Могу посоветовать вот этот вариант
http://flatagent.spb.ru/arenda/1480#more-1480 Останавливались, когда катались зимой, двухкомнатная квартира, все чисто и аккуратно, хозяйку зовут Ольга.
У нее 2 одинаковые квартиры на одном этаже. До Исаакия 5 минут пешком. Во дворе есть место для машины, двор закрывается, но мой тарракан туда еле-еле протискивался, слишком узкая и низкая арка, поэтому не заморачивался оставлял на улице. Тлф +79533481248
Прошлым летом останавливались в мини-гостинице Дом Достоевского
http://www.ddspb.ru/Тоже понравилось, своя стоянка, завтрак входит в цену, относительно центр.
Питер культурная столица, так что заходи на booking.com и найдешь гостиницу на свой вкус и кошелек. Я этим сайтом давно пользуюсь для бронирования, если еду в крупные города.